Die Mikrobiologische Therapie hat vielfältige Einsatzgebiete und eignet sich hervorragen dazu eine Stimulierung des Immunsystem vornehmen zu können. So wird bei der Mikrobiologischen Therapie gezielt ein bestimmter Stoff verabreicht, um dadurch das Immensystem zu stärken. Dabei gibt es eine ganze Reihe unterschiedlicher Behandlungsansätze, welche diverse Einflüsse auf den Organismus haben. Im Allgemeinen wird durch die  Mikrobiologische Therapie nicht nur ein Krankheitssymptom behandelt, vielmehr wird versucht, eine Erkrankung im gesamten zu heilen oder zumindest eine Linderung zu verschaffen. Die Übernahme der Kosten durch die gesetzliche Krankenkasse ist von Fall zu Fall unterschiedlich, bei der privaten Krankenversicherung findet in der Regel eine Kostenübernahme statt.